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小站点没有问题的，大站点可以使用linux平台来跑apache或nginx ，比windows效果要明显。
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本人使用过这两款软件
两者相比较，个人觉得Wamp会比较适合新人使用
因为它操作简单，没有phpstudy那过多的设置和选项
而且界面美观和操作直观，能直接管理WWW目录下的项目
当然，如果你想测试不同服务器和数据库的搭配，你可以选择phpstudy
它集成不同的php环境，有WAMP，有WNMP，还有WIMP
而且集成许多基本的功能，做服务器环境相比wamp会更加方便和安全
公司的同事如果不想认真配置php环境，一般都是直接给客户装phpstudy环境就OK了
本人的台式电脑目前安装的环境就是Wampserver2.2d，如果是新人学习的话，推荐Wamp
wamp集成的目的就是为了安装设置php环境的方便，其实质还是Apache/MySql/Php，从这个角度来说，你说的三个问题跟wamp关系不大，你单独一个个安装与用wamp一次性安装两者的安全、负载是一样的。
据我的理解，wamp不能是称之为“服务器的环境”，它只是一个集成的安装软件，它可以将多个独立的软件帮助你自动安装和配置一下，也就这个功能，至于服务器环境的搭建还是靠的A、M、P。
因此，对于你上面的三个问题，提供略答如下：
1、相对于独立安装，wamp环境有什么安全上的隐患？
独立安装与wamp一次性安装安全上的隐患差不多。
2、对于服务器的负载，wamp能做到多大？
同apache的负载。
3、wamp如果做为服务器的环境，有什么缺点？
wamp的版本更新没有自已安装时选择版本的自由度，通常wamp里的几个软件 Apache/MySql/Php 版本要比官网上单独下载的要低。