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针对的企业规模不同：
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SAP Business One针对的是中小微型的业务复杂程度较低的企业客户。
SAP R3（ECC）针对的是中大型的业务较为复杂的跨国、集团性企业客户。
技术架构不同：
SAP Business One是个打包的全面集成的系统，它包含了进销存（供应链）、财务、生产（订单级）、人力资源、客户关系管理（CRM）和系统管理等功能；并且所有功能模块都是默认就有的，购买软件licence以后所有的模块就都有了，不能分模块购买，如果要增强它的功能，SAp和其合作伙伴提供了许多叫做“附加项（ADD-ON）”的功能增强模块，提供了非常灵活的系统扩展性。
SAP R3（ECC）是组件化的系统，它包含了我们常见的：PP、MM、SD、FICO、QM、HR、CRM、ABAP（详细介绍可参考：SAP All-in-One 这篇文章）等等模块化组件供企业按需选择配置。
数据库不同：
SAP Business One是用SQL Server；
SAP R3早期应用的是oracle的数据库，现在应用的是IBM的DB2；
当然，现在也有SAP HANA。
项目复杂度及项目实施周期不同：
SAP Business One的一个中心设计思想就是要简单实用，所以它的定制、使用和实施都非常简单，一般一个项目1~2个月就可以完成了，一个具备基本的计算机操作技能的人能够很快的学会SAP Business One 的基本操作。
SAP R3（ECC）按不同模块，项目的实施周期需要根据企业的实际业务需求评估。
两款产品的联系：
1、都是德国SAP公司旗下的ERP产品，有着相似的管理理念及界面风格；
2、中小企业应用SAP Business One后，业务及规模扩大后可无缝升级为SAP R/3等高端系统；
3、大型企业可以在总部和重要工厂使用SAP R/3，而在小型工厂和分支机构采用SAP B1，这些系统之间可以无缝集成，实现数据共享；
4、 SAP Business One在功能上继承了SAP的主要特点，扩展性和灵活性较高，比如可以自定义流程、可以自定义扩展字段、自定义查询、自定义报表等等。
SAP R3是一个基于客户/服务机结构和开放系统的、集成的企业资源计划系统。其功能覆盖企业的财务、后勤（工程设计、采购、库存、生产销售和质量等）和人力资源管理、SAP业务工作流系统以及因特网应用链接功能等各个方面。（如图所示） R/3应用软体采模组化结构。它们既可以单独使用，也可以和其它解决方案相结合。从流程导向的角度而言，各应用软体间的整合程度越高，它们带来的好处就越多。 FI 财务会计 集中公司有关会计的所有资料，提供完整的文献和全面的资讯，同时作为企业实行控制和规划的最新基础。
SAP系统（全称：systemsandproctsindataprocessing）是SAP公司推出的一个企业管理工具。全球77%的交易收入都与SAP系统有关，SAP（思爱普）是ERP的代名词，是全球最大的企业管理和协同化商务解决方案供应商、全球第二大云公司。在中国有超过16,100多家客户。
SAP实施方法分为5步：
第一阶段：项目准备。包括：项目管理、项目组织培训、项目的初步实施计划、制定项目实施的规范及标准、启动项目网络/硬件技术环境的分析及规划、质量检查。
第二阶段：蓝图设计。包括：项目管理、项目组初中级培训、建立系统技术环境、企业组织结构确定、企业业务流程的描述、分析、优化及确定、质量检查。
第三阶段：系统实现。包括：项目管理、项目组高级培训、基本系统配置及确认、系统管理、最终系统配置及确认、开发数据转换程序、开发应用接口程序、开发外挂或扩展程序、报表定义、格式定义、权限定义及管理、归档定义及管理、系统集成测试、用户手册及培训资料、质量检查。
第四阶段：测试与准备。包括：项目管理、用户培训、系统管理、正式运行、技术环境的安装测试、系统性能、安全测试、制定明细运行计划、制定系统切换计划、制定系统运行支持计划、数据准备、系统切换、质量检查。
第五阶段：系统上线。项目管理、后续培训、提供用户支持、确认正式业务流程的正确性、优化系统的使用、制定后续长期计划、系统升级、系统日常维护、项目回顾。
学会的时间不会太长，因为也不是什么难事。