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许多软件是为windows设计的，Windows版的程序不能在其他平台上使用，除非使用模拟器比如wine，可以让一部分程序在Linux上使用。文件兼容性方面，一般的格式是通用的，比如音乐，图片文件，都是一样的格式，只是用不同平台上的软件打开；Openoffice， Eclipse当然不能直接复制过去，有对应品台的版本；本质区别.....就是他们是完全不同的操作系统，运行原理，内核还有文件夹管理不同；文件储存格式如果是主流的都是通用的，但要相关软件支持。
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小编讲讲几个windows系统的优缺点，大家可以斟酌选择。
1、win10系统
优点：是windows最新的系统版本。系统的兼容性很强，外展接口非常丰富，实用性非常强，画面更加清晰，系统的功能更完善，安全性很强。
缺点：经常自动更新，手动更新修复容易出现蓝屏，非常影响使用，对电脑的配置要求较高。由于新，所以稳定性也不够好。
2、win8系统
优点：开启速度比较快，支持触屏，采用Metro UI的主界面，流畅性也不错。安全性与稳定性都很不错。
缺点：功能都不是很实用，而且硬件要求也是挺高的。
3、win7系统
优点：画面比较和谐，安全性稳定性较好，不容易损坏，操作比较简单。
缺点：容易蓝屏，画面不是特别清晰，软件兼容性不是很高。而且现在新的电脑和驱动不太适合装win7
4、xp系统
优点：运行速度快，容量小，兼容性比较好，不容易损坏。
缺点：系统漏洞多，容易蓝屏，而且系统画面不是特别的人性化，用起来不是很方便。目前也停止更新维护了。
总的来说，现在新电脑的话都是推荐使用win10，系统和驱动兼容性都比较好。大部分人现在都是使用win10和win7。win8比较适合一般平板、触控电脑。xp系统的话现在比较少人用了，如果是一些比较老的电脑机型的话可以选win7和xp。
其实都很好用，主要看你习惯用那个系统吧，不过相比较而言，Windows更普遍，更能为大众所接受，而ios毕竟限制还是比较多的，但是用起来很舒服，也很流畅。
iOS是由苹果公司开发的移动操作系统。苹果公司最早于2007年1月9日的Macworld大会上公布这个系统，最初是设计给iPhone使用的，后来陆续套用到iPod touch、iPad以及Apple TV等产品上。iOS与苹果的Mac OS X操作系统一样，属于类Unix的商业操作系统。原本这个系统名为iPhone OS，因为iPad，iPhone，iPod touch都使用iPhone OS，所以2010WWDC大会上宣布改名为iOS（iOS为美国Cisco公司网络设备操作系统注册商标，苹果改名已获得Cisco公司授权）。2014年11月14日，美国政府部门周四警示称，苹果设备的用户应当注意，黑客可能会利用近期发现的苹果iOS系统的一个新漏洞。
Microsoft Windows,是美国微软公司研发的一套操作系统，它问世于1985年，起初仅仅是Microsoft-DOS模拟环境，后续的系统版本由于微软不断的更新升级，不但易用，也慢慢的成为家家户户人们最喜爱的操作系统。Windows采用了图形化模式GUI，比起从前的DOS需要键入指令使用的方式更为人性化。随着电脑硬件和软件的不断升级，微软的Windows也在不断升级，从架构的16位、32位再到64位， 系统版本从最初的Windows 1.0 到大家熟知的Windows 95、Windows 98、Windows ME、Windows 2000、Windows 2003、Windows XP、Windows Vista、Windows 7、Windows 8、Windows 8.1、Windows 10 和 Windows Server服务器企业级操作系统，不断持续更新，微软一直在致力于Windows操作系统的开发和完善。