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1：较频繁作为查询、排序、分组和联合操作的字段创建索引。
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2：唯一性太差的字段不宜使用索引。
3：使用唯一索引。
4：使用短索引（若对字符串索引，尽量指定一个前缀长度）。
5：利用左前缀（复合索引可以起几个索引的作用，可利用索引最左边的列集来匹配行，称左前缀）
6：不要过度索引（每个索引会占用额外的磁盘空间，并降低写操作的能力，修改数据索引也跟着更新）
7：更新非常频繁的字段不宜创建索引。
8：不会出现在where字句中的字段无需索引。
错误信息说你的参数 $qa_id_array 不是数组类型，可能SQL查询结果为空或者遇到了错误，你可以在9行前面增加下面的调试语句看看结果：
echo 'pre';
print_r( $qa_id_array );
echo '/pre';
补充：
我把程序全部给你修改了可以不，你那些变量命名我不习惯。
而且你$qa_id = array_values($qa_id_array);之后就当$qa_id作为字符串使用是错误的。
修改后的程序如下：
?php
include ("./mysqlconn.php");
mysql_connect($mysqlserver,$mysqluser,$mysqlpassword)
or die("Could not connect: " . mysql_error());
mysql_select_db('pmwebsys');
$sql = "SELECT * FROM col_qarecord";
if ($res=mysql_query($sql)){
$row = mysql_fetch_array($res);
$qa_id = join(',', $row);
$sql="UPDATE col_qarecord SET qa_id = '$qa_id'";
if (mysql_query($sql)) echo '修改成功';
else echo "SQL:$sqlbr\n错误:".mysql_error();
}else echo "SQL:$sqlbr\n错误:".mysql_error();
?
补充：
join错误是因为select语句没有返回结果，你的col_qarecord表可能是空的吧，一条记录也没有。
补充：
数据库记录都清空了，你还select个什么呢？！还update个什么呢？！
MYSQL的索引是在数据库任何修改的时候（删除、修改、添加）自动重建的，你如果是需要修改自动编码字段的值，请在phpmyadmin里面直接修改即可，我们这两天调试的这个破程序没有任何效果，除了浪费时间以外。
补充：
Data truncated for column 'qa_id' at row 1表示你UPDATE给字段qa_id的内容超过了字段定义的长度。
补充：
int只能存放一个整数，你粘贴输出的SQL就知道了。
补充：
我感觉你都明白了的，你知道你还有什么问题，能够明确的提个为什么吗
你这个问题我有些没看懂。。。php或者其他程序语言，通过连接数据库执行sql语句存入想要存入的数据，索引是建表时在数据库添加的，当然也可以通过php来实现。
你说的是数据库索引？
如果是数据库索引没有强制的方法。
数据结构。php缺少索引层就是缺少一个排序的数据结构，索引是指数据库管理系统中一个排序的数据结构，并用以协助快速查询、 更新数据库表中数据。
无论数据库或系统都是 先生成索引,然后从索引中读取....
有更新就往索引文件中更新就行....
如linux或window中第一次搜索都很慢,建立索引之后就闪搜了...
100万条数据也不算多,把这个大索引再分成100份或更多,1万条一份..
1 0---1W
2 1w---2w
3 2w--3w
....
如果你觉得1万条记录读起来还吃力的话,那就分多一点....
然后把索引放都放到cache里,把主索引做成hash表排列....
说白了就把它放到数据库里(nosql)