189 8069 5689
一图解决疑问。功能路径是 settingsFile and code TemplatesGo File 。其他文件也一样。
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功能路径是 settingsLive Templates 。
使用方法是在编辑窗口中敲击 lgh （可改），等待提示后按 tab 键即可。
Java是一门较为成熟的语言,相对于C++要简单的多,C++里没有内存回收,所以比较麻烦,Java加入了内存自动回收,简单是简单,却变慢了,go语言是一门新兴的语言,现在版本是1.9 ? go语言的性能比Java要好,但由于出现晚,资料较Java少,有些Java的功能go也没有,并且有许多的软件是支持Java但支持go的很少.所以在短期内Java是比go通用的
C语言的最大的优势是时间性能好,只比汇编慢20%~30%,C++最大的优势是快且面向对象,Java最大的优势是垃圾回收机制,GO语言的目标是具备以上三者的优势
一直很好奇GO注释文件中的信息是如何得到的，终于在《The Gene Ontology Handbook》中找到了答案。
GO的原始文件可以分为两部分：ontology和association files。
该文件以obo格式储存，每个词条都以树状结构表示着和其他词条的关系，具体内容可以从 GO网站 中找到，其中的元素和逻辑关系可以简单参考上几篇文章。主要编辑工具有go-basic、go和go-plus三个。
这部分文件主要是关于GO词条的具体功能信息，以及相关的支撑信息，以GAF或GPAD格式储存。
目前对基因的注释主要有两种手段：人工注释和机器注释。
人工注释由专业人士(biocurators)通过阅读，提取和转化文献中的实验结果来对基因进行注释。人工注释费时费力，但他们的努力非常重要，因为人工注释的准确性是其他注释的基石，目前有20个团队为GO的人工注释贡献力量。
机器注释主要两大类方法：根据序列进行注释和文本挖掘的方法注释。
1、根据序列信息进行注释：
annotation transfers from Homologous proteins
annotation transfers from Orthologous proteins
annotation transfers from Protein families
2、文本挖掘注释
Automatic text categorization
Lexical approaches
k-Nearest neighbors
Properties of Lexical and k-NN categorizers
Inter-annotator agreement
每种方法的具体解释参考《The Gene Ontology Handbook》的相关章节。
Go语言中没有“类”的概念，也不支持“类”的继承等面向对象的概念。Go语言中通过结构体的内嵌再配合接口比面向对象具有更高的扩展性和灵活性。
自定义类型
在Go语言中有一些基本的数据类型，如string、整型、浮点型、布尔等数据类型， Go语言中可以使用type关键字来定义自定义类型。
自定义类型是定义了一个全新的类型。我们可以基于内置的基本类型定义，也可以通过struct定义。例如：
通过Type关键字的定义，MyInt就是一种新的类型，它具有int的特性。
类型别名
类型别名是Go1.9版本添加的新功能。
类型别名规定：TypeAlias只是Type的别名，本质上TypeAlias与Type是同一个类型。就像一个孩子小时候有小名、乳名，上学后用学名，英语老师又会给他起英文名，但这些名字都指的是他本人。
type TypeAlias = Type
我们之前见过的rune和byte就是类型别名，他们的定义如下：
类型定义和类型别名的区别
类型别名与类型定义表面上看只有一个等号的差异，我们通过下面的这段代码来理解它们之间的区别。
结果显示a的类型是main.NewInt，表示main包下定义的NewInt类型。b的类型是int。MyInt类型只会在代码中存在，编译完成时并不会有MyInt类型。
Go语言中的基础数据类型可以表示一些事物的基本属性，但是当我们想表达一个事物的全部或部分属性时，这时候再用单一的基本数据类型明显就无法满足需求了，Go语言提供了一种自定义数据类型，可以封装多个基本数据类型，这种数据类型叫结构体，英文名称struct。 也就是我们可以通过struct来定义自己的类型了。
Go语言中通过struct来实现面向对象。
结构体的定义
使用type和struct关键字来定义结构体，具体代码格式如下：
其中：
举个例子，我们定义一个Person（人）结构体，代码如下：
同样类型的字段也可以写在一行，
这样我们就拥有了一个person的自定义类型，它有name、city、age三个字段，分别表示姓名、城市和年龄。这样我们使用这个person结构体就能够很方便的在程序中表示和存储人信息了。
语言内置的基础数据类型是用来描述一个值的，而结构体是用来描述一组值的。比如一个人有名字、年龄和居住城市等，本质上是一种聚合型的数据类型
结构体实例化
只有当结构体实例化时，才会真正地分配内存。也就是必须实例化后才能使用结构体的字段。
基本实例化
举个例子：
我们通过.来访问结构体的字段（成员变量）,例如p1.name和p1.age等。
匿名结构体
在定义一些临时数据结构等场景下还可以使用匿名结构体。
创建指针类型结构体
我们还可以通过使用new关键字对结构体进行实例化，得到的是结构体的地址。 格式如下：
从打印的结果中我们可以看出p2是一个结构体指针。
需要注意的是在Go语言中支持对结构体指针直接使用.来访问结构体的成员。
取结构体的地址实例化
使用对结构体进行取地址操作相当于对该结构体类型进行了一次new实例化操作。
p3.name = "七米"其实在底层是(*p3).name = "七米"，这是Go语言帮我们实现的语法糖。
结构体初始化
没有初始化的结构体，其成员变量都是对应其类型的零值。
使用键值对初始化
使用键值对对结构体进行初始化时，键对应结构体的字段，值对应该字段的初始值。
也可以对结构体指针进行键值对初始化，例如：
当某些字段没有初始值的时候，该字段可以不写。此时，没有指定初始值的字段的值就是该字段类型的零值。
使用值的列表初始化
初始化结构体的时候可以简写，也就是初始化的时候不写键，直接写值：
使用这种格式初始化时，需要注意：
结构体内存布局
结构体占用一块连续的内存。
输出：
【进阶知识点】关于Go语言中的内存对齐推荐阅读:在 Go 中恰到好处的内存对齐
面试题
请问下面代码的执行结果是什么？
构造函数
Go语言的结构体没有构造函数，我们可以自己实现。 例如，下方的代码就实现了一个person的构造函数。 因为struct是值类型，如果结构体比较复杂的话，值拷贝性能开销会比较大，所以该构造函数返回的是结构体指针类型。
调用构造函数
方法和接收者
Go语言中的方法（Method）是一种作用于特定类型变量的函数。这种特定类型变量叫做接收者（Receiver）。接收者的概念就类似于其他语言中的this或者 self。
方法的定义格式如下：
其中，
举个例子：
方法与函数的区别是，函数不属于任何类型，方法属于特定的类型。
指针类型的接收者
指针类型的接收者由一个结构体的指针组成，由于指针的特性，调用方法时修改接收者指针的任意成员变量，在方法结束后，修改都是有效的。这种方式就十分接近于其他语言中面向对象中的this或者self。 例如我们为Person添加一个SetAge方法，来修改实例变量的年龄。
调用该方法：
值类型的接收者
当方法作用于值类型接收者时，Go语言会在代码运行时将接收者的值复制一份。在值类型接收者的方法中可以获取接收者的成员值，但修改操作只是针对副本，无法修改接收者变量本身。
什么时候应该使用指针类型接收者
任意类型添加方法
在Go语言中，接收者的类型可以是任何类型，不仅仅是结构体，任何类型都可以拥有方法。 举个例子，我们基于内置的int类型使用type关键字可以定义新的自定义类型，然后为我们的自定义类型添加方法。
注意事项： 非本地类型不能定义方法，也就是说我们不能给别的包的类型定义方法。
结构体的匿名字段
匿名字段默认采用类型名作为字段名，结构体要求字段名称必须唯一，因此一个结构体中同种类型的匿名字段只能有一个。
嵌套结构体
一个结构体中可以嵌套包含另一个结构体或结构体指针。
嵌套匿名结构体
当访问结构体成员时会先在结构体中查找该字段，找不到再去匿名结构体中查找。
嵌套结构体的字段名冲突
嵌套结构体内部可能存在相同的字段名。这个时候为了避免歧义需要指定具体的内嵌结构体的字段。
结构体的“继承”
Go语言中使用结构体也可以实现其他编程语言中面向对象的继承。
结构体字段的可见性
结构体中字段大写开头表示可公开访问，小写表示私有（仅在定义当前结构体的包中可访问）。
结构体与JSON序列化
JSON(JavaScript Object Notation) 是一种轻量级的数据交换格式。易于人阅读和编写。同时也易于机器解析和生成。JSON键值对是用来保存JS对象的一种方式，键/值对组合中的键名写在前面并用双引号""包裹，使用冒号:分隔，然后紧接着值；多个键值之间使用英文,分隔。
结构体标签（Tag）
Tag是结构体的元信息，可以在运行的时候通过反射的机制读取出来。 Tag在结构体字段的后方定义，由一对反引号包裹起来，具体的格式如下：
`key1:"value1" key2:"value2"`
结构体标签由一个或多个键值对组成。键与值使用冒号分隔，值用双引号括起来。键值对之间使用一个空格分隔。 注意事项： 为结构体编写Tag时，必须严格遵守键值对的规则。结构体标签的解析代码的容错能力很差，一旦格式写错，编译和运行时都不会提示任何错误，通过反射也无法正确取值。例如不要在key和value之间添加空格。
例如我们为Student结构体的每个字段定义json序列化时使用的Tag：
Ontology 首先是出现于哲学领域的一个词汇，后来广泛用于计算机领域，发挥了很重要的作用，再后来这个概念被引入生物领域。
gene Ontology 是生物中Ontology中一个重要应用。go项目最初是由研究三种模式生物（果蝇、小鼠和酵母）基因组的研究者共同发起。是生物信息分析中很重要的一个方法
go是在生物领域应用非常广，可以帮助生物学家对基因产物进行准确的定义（功能、位置），节省时间。
因为在最开始的时候，生物学家们更多是专注于自己研究的物种/课题，而且每个生物学家对功能等的定义是存在差异的，导致不同实验室/物种不能实现直接的对接（比如A物种内的x基因的功能使用的是a这个词汇进行注释，而B物种内的x基因的功能却使用的是与a同义的词汇b进行注释，这种情况计算机无法识别），就像讲两种语言的人，无法直接进行语言交流。这种情况导致的问题是，出现了一种阻碍，让问题复杂化了。所以就有了Ontology在生物领域中的应用，实现“书同文”。
go定义了基因/基因产物的功能（通过术语）且定义了它们各自之间功能是怎样联系的（关系）。它组成了一个具有大量term的词汇库，并定义各种term之间的关系（is_a part_of R）。
GO通过三个方面的术语对基因/基因产物的功能进行描述：分子功能(molecular function) -由基因/基因产物行使的分子水平上的功能； 细胞组件(cellular component)-基因/基因产物产生功能时其在细胞结构上的位置；生物学过程(biological process)-在哪个生物学通路/生物过程发挥作用。
目前，GO 注释主要有两种方法：
（1）序列相似性比对（BLAST）：例如blast2go（将blast结果转化为GO注释）
（2）结构域相似性比对（InterProScan）
blast2go的本地化教程：
在blast2go软件正确安装的情况下，使用blast2go进行go注释，出现无法得到注释结果的问题：
另外还有可能出错的原因是，blast2go无法识别blast高的版本号，当使用高版本的blast的时候，直接将版本号给修改为低版本的就行了，例如（BLASTX 2.2.25+）
GO 的图形是一个有向无环图
Go语言也称 Golang，兼具效率、性能、安全、健壮等特性。这套Go语言教程（Golang教程）通俗易懂，深入浅出，既适合没有基础的读者快速入门，也适合工作多年的程序员查阅知识点。
Go 语言
这套教程在讲解一些知识点时，将 Go 语言和其他多种语言进行对比，让掌握其它编程语言的读者能迅速理解 Go 语言的特性。Go语言从底层原生支持并发，无须第三方库、开发者的编程技巧和开发经验就可以轻松搞定。
Go语言（或 Golang）起源于 2007 年，并在 2009 年正式对外发布。Go 是非常年轻的一门语言，它的主要目标是“兼具 Python 等动态语言的开发速度和 C/C++ 等编译型语言的性能与安全性”。
Go语言是编程语言设计的又一次尝试，是对类C语言的重大改进，它不但能让你访问底层操作系统，还提供了强大的网络编程和并发编程支持。Go语言的用途众多，可以进行网络编程、系统编程、并发编程、分布式编程。
Go语言的推出，旨在不损失应用程序性能的情况下降低代码的复杂性，具有“部署简单、并发性好、语言设计良好、执行性能好”等优势，目前国内诸多 IT 公司均已采用Go语言开发项目。Go语言有时候被描述为“C 类似语言”，或者是“21 世纪的C语言”。Go 从C语言继承了相似的表达式语法、控制流结构、基础数据类型、调用参数传值、指针等很多思想，还有C语言一直所看中的编译后机器码的运行效率以及和现有操作系统的无缝适配。
因为Go语言没有类和继承的概念，所以它和 Java 或 C++ 看起来并不相同。但是它通过接口（interface）的概念来实现多态性。Go语言有一个清晰易懂的轻量级类型系统，在类型之间也没有层级之说。因此可以说Go语言是一门混合型的语言。
此外，很多重要的开源项目都是使用Go语言开发的，其中包括 Docker、Go-Ethereum、Thrraform 和 Kubernetes。Go 是编译型语言，Go 使用编译器来编译代码。编译器将源代码编译成二进制（或字节码）格式；在编译代码时，编译器检查错误、优化性能并输出可在不同平台上运行的二进制文件。要创建并运行 Go 程序，程序员必须执行如下步骤。
使用文本编辑器创建 Go 程序；
保存文件；编译程序；运行编译得到的可执行文件。
这不同于 Python、Ruby 和 JavaScript 等语言，它们不包含编译步骤。Go 自带了编译器，因此无须单独安装编译器。
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