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PHP和MySQL都是开源，并且PHP对MySQL的支持程度非常高。
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ASP和SQL都是微软的东西，用东西当然先用自已家里的了，并且微软的SQL对ASP支持也好。
JSP和ORACLE，应该是因为JSP适合做企业级的开发，如果用MySQL可能在性能上达不到，所以选择ORACLE，SQL仅支持Windows系统，而Java和ORACLE都是跨平台的，也这符合企业的要求。
个人认为放在同一台服务器上比较好
1.数据库在本地的话，网站的速度肯定会比异地快。
2.数据库在本地的话可一定程度上提高安全性，因为我们建立数据库时可以把账号权限设置成localhost也就是本地127.0.0.1这样的话即使知道数据库账号密码也无法在远程入侵。
3.可以节省一台服务器的费用，一般的VPS运行apache+php+mysql+phpmyadmin+zend都不吃力的.
纯属个人经验，如有不妥请多指点！
PHP（PHP： Hypertext Preprocessor，超文本预处理器的字母缩写）是一种被广泛应用的开放源代码
的多用途脚本语言，它可嵌入到 HTML中，尤其适合 web 开发。
早期 php和mysql数据库紧密绑定
到php 5 以后 php转向 pdo操作数据库 将mysql剥离出php核心 默认支持数据库采用 SQLite
你用php建站 采用 pdo SQLite 是以后的潮流方向了
当然 中型 网站 还会采用 pdo mySQL的方式
Linux下PHP连接MS SQLServer的办法
分析问题
本来PHP脚本读写SQLServer是没有什么问题的，在Apache for windows和Windows IIS下可以工作的很好，一般可以通过ODBC或SQLServer Client连接，这都是Windows下面现成的。但是在Linux下面没有现成的ODBC和SQLServer Client，需要我们自己安装。
解决问题
一、相关软件
freetds-0.53.tgz
这个软件能够用Linux和Unix连接MS SQLServer和Sybase数据库。
二、安装配置步骤
第一步：编译安装freetds:
得到freetds-0.53.tgz后
cp freetds-0.53.tgz /tmp/. （拷贝freetds包到/tmp目录）
cd /tmp （进入目录）
tar zxvf freetds-0.53.tgz （解压）
cd freetds-0.53 （进入解压后目录）
./configure –prefix=/usr/local/freetds --with-tdsver=7.0
gmake （生成Makefile，我试验过，make也可以）
gmake install （安装）
关于上面configure我想说一下，--prefix=/usr/local/freetds是指安装到/usr/local/freetds这个目录中，--with-tdsver=7.0是指安装tds 7.0版本（最开是我没有加这个编译参数，结果按照默认编译为5.0。5.0连接数据库的端口是4000，不是SQLServer的1433）
第二步：重新编译PHP4
./configure [--with-apxs --with-mysql...] --with-sybase=/usr/local/freetds（请注意是sybase）
make
make install
第三步:配置freetds
vi /usr/local/freetds/etc/freetds.conf
具体配置见该文件中的说明
例: （典型配置）
[sqlserver]
host = sql_server_name_or_host_ip （你的SQLServer机器名字或者IP地址）
port = 1433
tds version = 7.0
在这个配置文件中可以配置Windows域登陆或者SQLServer账号登陆两种方式
第四步:配置php.ini文件
找到 ;extension=mssql70.so
将注释;去掉成
extension=mssql70.so
第五步:在php中建立数据库连接
$link=mssql_connect("sqlserver",$your_username,$your_password) or die (“can’t Connect to Database”);
echo $link;
在浏览器中运行上面脚本， 如果你得到一个link号那么恭喜，你已经配置好了，如果出现Call to undefined function: mssql_connect() 那说明仔细看上面的安装配置过程看你哪一步没有对。
注意:sqlserver名称是在/usr/local/freetds/etc/freetds.conf中定义的host参数，如果你写的IP地址，就是IP地址。
其他数据库操作参考相关mssql函数
注意,在sql语句中不支持中文!!!
第六步：调试
如果出现不能连接，请在freetds配置文件中找到;dump file = /tmp/freetds.log这一行，注释掉前面的分号，再执行一下测试脚本，察看/tmp/freetds.log文件，它可以告诉你很多出错的信息帮助你排除问题。
PHP与Oracle数据库连接
PHP提供了两套函数与Oracle连接，分别是ORA_和OCI函数。其中ORA_函数略显陈旧。OCI函数更新据说更好一些。两者的使用语法几乎相差无几。如前所述，你的PHP安装选项应该可以支持两者的使用。
连接
if ($conn=Ora_Logon("user@TNSNAME","password"))
{
echo "SUCCESS ! Connected to database\n";
}
else
{
echo "Failed :-( Could not connect to database\n";
}
Ora_Logoff($conn);
phpinfo();
?
以上代码使用TNSNAME(在你的tnsnames.ora文件中指明)定义的Oracle数据库名称、用户名称和密码连接数据库。在成功连接的基础上，ora_logon函数返回一个非零的连接ID并储存在变量$conn中。
详细内容
普及网/blog/item/3fe4df12c474e9956438db72.html
肯定是mysql咯，从两个方面可以看出来：第一，你搜一下那些招聘单位的要求，你就会发现大部分都是要求精通mysql+php，第二，你看下php手册，你会发现只有php里只有操作mysql的函数是已经内建的，其他都需要自己手动书写，比如连接数据库函数mysql_content，mysql_query，mysql_fetch_object等等，而其他数据库没有这个待遇哦
一、PHP+MySql
优点：
1) MySql是一个快速、多线程、多用户的SQL数据库服务器。
2) MySql的核心程序采用完全的多线程编程。
3)MySql可运行在不同的操作系统下。
4) MySql有一个非常灵活而且安全的权限和口令系统。
5) MySql支持ODBC for Windows。
6)MySql支持大型的数据库。
7) MySql拥有一个非常快速而且稳定的基于线程的内存分配系统，可以持续使用面不必担心其稳定性。
8) 强大的查询功能。
9)PHP为MySql提供了强力支持，PHP中提供了一整套的MySql函数，对MySql进行了全方位的支持。
缺点：
比较的难学;
MySQL不完全支持陌生的关键词;
MySQL也缺乏一些存储程序的功能;
使用缺省的ip端口，但是有时候这些ip也会被一些黑客闯入;
使用myisam配置，如果你不慎损坏数据库，结果可能会导致所有的数据丢失;
二、PHP+MsSql
优点：
上手容易; 兼容性良好; 利于构筑"敏捷性商务";
缺点:
只能在windows 上运行，没有丝毫的开放性，操作系统的系统的稳定对数据库是十分重要的。
并行实施和共存模型并不成熟。很难处理日益增多的用户数和数据卷。伸缩性有限;
安全性方面，没有获得任何安全证书;
客户端支持及应用模式 ，是C/S结构，只支持windows客户，可以用ADO, DAO,OLEDB,
ODBC连接;
不是免费的;
数据不容易恢复;