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我在这里列出了它们的本质区别和用法区别：
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一、本质区别：
1.js都知道是网页脚本语言，类似java是一种开发常用语言；
2.jQuery是基于js语言封装出来的一个前端框架；
所以最本质的区别就是js是一种语言，而jQuery是基于该语言的一种框架。除却最本质的区别还有一些用法上的差别。
二、用法区别：
1.外观上
jQuery对象比js对象多了"$()"一层马甲，这是最直观的区别；
2.操作内容
①.非表单元素（如果是文本就用text方法，如果是html代码就用html方法）
例：div.text();——无参数的情况下是取值
div.text("aaaa");——有参数的情况下是赋值
div.html();——无参数的情况下是取值
div.html("aaaa");——有参数的情况下是赋值
②.表单元素
JS：div.value;——取值；div.value = xxx;——赋值
JUQERY：div.val();——无参数是取值，有参数是赋值。
3.操作属性
JS里面用来操作属性的方法是
div.setAttribute("","");——设置属性、修改属性
div.removeAttribute("");——移除属性，引号里面写一个属性名
div.getAttribute();——获取属性
JQUERY里面用来操作属性的方法
添加属性：div.attr("test","aa");——给这个attr方法加入参数，属性名叫做test，属性的值是aa
移除属性：div.removeAttr("test");——移除test这条属性
获取属性：div.attr("test");——在attr方法里面直接写入一个属性的名就可以了
4.操作样式
JS里面操作样式的关键字是style
例：div.style.backgroundColor = "red";——把这个div的背景色设置成为了红色
JQUERY里面操作样式的关键字是css
例：div.css("background-color","yellow");——把这个div的背景色变为黄色，在这里CSS里面所有的样式和css样式表里面的样式是一模一样的没有任何变化
JS操作样式的方法只能获取内联样式，不能取内嵌的和外部的！！！！！
JQUERY操作样式的方法可以是内联的也可以是内嵌的
以上就是我总结它们两者的区别，希望对你有所帮助。
jQuery是一个js框架，封装了js的属性和方法。操作方法如下：
1、首先，要定义出页面对应的dom对象（这个不是必须的，可以在页面加载的时候，动态添加到页面尾部）。
2、定义对应的css样式，样式已添加了对ie6等低版本浏览器的支持。
3、初始化控件，当然第一步所说的动态添加，也在这步所示，代码包括初始化和关闭按钮控件。
4、初步做好了弹出框，添加自适应窗口的优化,包括各浏览器中获取宽高方法。
5、最后弹出框增加鼠标拖动的效果，鼠标变十字后就可拖动了，就完成了。
本质上的区别
jQuery是一个JavaScript函数库。jQuery就是基于JavaScript语言写出来的一个框架,实质上还是JavaScript而已。
代码书写的不同
jQuery 简化了 JavaScript 编程，jQuery代码比JavaScript轻灵，jquery设计的初衷就是要用很少的代码，完成很多的功能。
使用方法上的不同
（1）使用JavaScript和jQuery分别加载DOM：
JavaScript只会执行一次，而jQuery会执行多次。
（2）使用JavaScript和jQuery获取class方法：
JavaScript没有默认的获取class的方法 ，而JQuery可以通过$('.className') 调用class的方法。